AATI高通量毛細管電泳儀的詳細介紹
1.應用背景:從組織、細胞或器官中提取基因組DNA(gDNA)是所有后續DNA分析中尤為重要的步。迄今為止,gDNA的定量和定性均需要兩種不同的儀器來完成,一種用于定性分析,另一種用于定量分析。
由美國AATI公司研發的Fragment AnalyzerTM系統平臺,則可對gDNA同時進行定性定量分析,而且樣品需要量少,分析速度快。
2.Fragment AnalyzerTM的優勢
- 擁有gDNA檢測試劑盒的儀器
- 可分析15000bp以上大片段
- 可同時定性和定量
- 適用于NGS中gDNA的質控
3.Fragment AnalyzerTM系統應用示例
圖1:Fragment AnalyzerTM系統下基因組DNA分離結果(右),數字凝膠成像圖(左),λDNA(F6);HindIII Marker(紅色);完整DNA(D1和藍色);降解DNA(B1和綠色)
圖2:Fragment AnalyzerTM系統下DNA大片段分離(上)和定量(下)結果。定量結果顯示,DNA大片段彌散范圍主要在1000-10000bp,同時計算出各個樣品的濃度(μg/μl),比例(% total),摩爾分數(nmole/L),平均片段長度(Avg.Size),變異系數(%CV)
圖3:Fragment AnalyzerTM系統,lamda DNA/HindIII ladder以及1Kb DNA extension ladder的分離結果,高達40000bp的大片段亦可獲得的分辨率。
圖4:Fragment AnalyzerTM系統下基因組DNA分析結果,A1-C1為降解的基因組DNA,其平均片段長度<5kb,D1-F1為完整的基因組DNA,平均片段長度>9kb。
圖5 左:沙門氏菌基因組基因組DNA數碼凝膠圖像-類似傳統的平板凝膠圖像。然而,圖像是由能夠同時分析12或96個樣品的全自動毛細管電泳儀產生。 右:相同樣品的凝膠電泳,上部曲線為完整的基因組DNA,往下依次為不同降解程度的基因組DNA電泳圖譜。