調控區域靶向捕獲甲基化測序技術

調控區域靶向捕獲甲基化測序技術（LHC-Seq）是通過設計相應的探針序列，特異性捕獲感興趣的基因片段，捕獲序列進一步通過重亞硫酸鹽處理，高通量測序分析目標區域的甲基化水平。該技術是大樣本量，固定區域甲基化檢測的優選，可廣泛應用于臨床樣本甲基化特異性區域的鑒定以及與疾病相關的甲基化Bio-Marker的篩選和驗證。

調控區域靶向捕獲甲基化測序技術可服務的范圍如下：

1. 常規芯片捕獲服務包括自主研發的全基因組啟動子及關鍵調控區域的芯片（promoter capture-BS）、全外顯子芯片（exome-BS）及NimbleGen的SeqCap Epi芯片等
2. 個性化探針設計，可根據不同需要協助完成靶區域的探針合成及相關服務
3. 提供單樣本雜交和多樣本混合后pooling雜交的服務策略，可*地降低實驗成本。

4. 數據解讀分析內容

5. 數據產出、過濾和質控
   • 下機數據過濾和質控圖表，去污染、接頭
   • 統計reads長度，reads數據，數據產量
6. 數據比對、甲基化信息
   • 比對結果、Bisulfite轉化率統計，捕獲效率統計
   • 目標區域內覆蓋度以及覆蓋深度統計
   • 目標區域內甲基化修飾位點及水平結果
7. 甲基化修飾特征
   • 目標區域甲基化修飾水平的特征及統計
8. 差異甲基化修飾區域
   • 差異甲基化修飾區域(DMR)的鑒定和注釋
9. 差異甲基化修飾基因
   • 差異甲基化修飾基因功能和通路分析。

10. 樣本要求

11. 樣品類型：無降解，無污染的DNA樣品；
12. 樣品需求量：單個樣本雜交的起始量大于3μg；多樣本混合雜交，每個樣本的基因組DNA量大于1.5μg。
13. 樣品濃度：≥30 ng/μl;
14. 樣品純度：OD260/280=1.8~2.0，不含蛋白和RNA等污染